Por: NOE VDF
El proceso de RNA interferente (RNAi) es un mecanismo molecular donde un RNA pequeño suprime la expresión de transcritos codificantes. El RNAi fue inicialmente descrito como un mecanismo de silenciamiento inducido por la introducción experimental de un RNA de doble cadena (dsRNA) en el nematodo Caenorhabditis elegans 1 En los ensayos realizados por A. Fire y C. Mello (premios Nobel en 2006), se observo que al introducir un dsRNA se silenciaba la expresión de un gen blanco de manera especifica, determinaron que dicho dsRNA era el detonador del proceso de silenciamiento sin saber en ese momento los eventos moleculares que explicaran el fenómeno. A la fecha, se sabe que cuando un dsRNA es introducido en la célula, este es procesado por una RNasa tipo III llamada Dicer, el corte por Dicer produce fragmentos de dsRNAs llamados RNAs pequeños interferentes (siRNAs) de 21 nucleótidos de tamaño. Una cadena del duplex siRNA es incorporada a un complejo proteico efector del silenciamiento, denominado Complejo de Silenciamiento Inducido por RNA (RISC), el cual corta o reprime la traducción del RNA mensajero blanco guiado por la complementariedad con el siRNA y la actividad catalítica de proteínas Argonauta. En plantas, se pueden formar dsRNAs endógenos por la acción de una RNA Polimerasa Dependiente de RNA (RdRP); sin embargo, los mamíferos carecen de la actividad de RdRP y su única fuente de dsRNA que detona el RNAi es exógena. El 10 de abril en la revista Nature se publicaron dos artículos 2 3que demuestran una fuente endógena de siRNAs en ratón. Los estudios sugieren que en líneas germinales femeninas (Oocitos) el control de Retrotransposones, regiones de invertidos repetidos y transcritos codificantes, es mediado por siRNAs endógenos (endo-siRNAs) que dependen de Dicer y Argonauta 2. Interesantemente en ambos estudios, la secuenciación profunda de los perfiles de small RNAs de 21 nt, indica que los dsRNAs se pueden formar por la hibridación de un transcrito codificante con el transcrito correspondiente a su pseudogen. De esta manera, los siRNAs derivados de pseudogenes pueden ser capaz de regular a su transcrito homologo por mecanismos convencionales de RNA interferente (ver figura).
Estos dos artículos, junto con el estudio de Ghildiyal et al, 2008 4, amplían nuestro conocimiento sobre la diversidad de mecanismos reguladores de expresión génica y, además rompen con el esquema de que los pseudogenes son artefactos no funcionales del genoma.
Referencias
1. Fire, A. et al. Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans. Nature 391, 806-11 (1998).
2. Tam, O.H. et al. Pseudogene-derived small interfering RNAs regulate gene expression in mouse oocytes. Nature (2008).
3. Watanabe, T. et al. Endogenous siRNAs from naturally formed dsRNAs regulate transcripts in mouse oocytes. Nature (2008).
4. Ghildiyal, M. et al. Endogenous siRNAs Derived from Transposons and mRNAs in Drosophila Somatic Cells. Science (2008).
3 comentarios:
Interesante, Crees que en plantas pueda haber un mecanismo similar? Sabes como se determina a una secuencia como pseudo-gen? es simplemente porque no se ha encontrado su mensajero?
Me gustaria agregar la gran diferencia en opiniones sobr el concepto de pseudo-gen En una platica sobre si regiones intergenicas expresadas al azar por duplicaciones genicas o fragmentos de cDNA cerca de un potenciador se expresa sin sentido...la verdad no me queda claro el termino y la funcion de esas expresiones, lamentablemente si uno quiere utilizar la definicion de pseudogen, te encuentras con otras opiniones (simplistas, son buenas pero no contundentes) que dicen
si se expresa, es un gen...
quiero agregarle una funcion, realmente quiero creer en un pseudogen de un lado parte del proceso evolutivo accidental que con el tiempo se fijan y su expresion, parte de su definicion.
pero no quisiea encasillarlo en el sentido extricto de gen.
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